Die DGON ist in drei Kommissionen und fünf Fachausschüsse organisiert, die jeweils auf dem neuesten Stand sind und für die Fachgebiete regelmäßig Konferenzen und Symposien gestalten. Die Kommissionen teilen sich in die Luftfahrtkommission, die Schifffahrtkommission und die Kommission Landverkehr. Auf der wissenschaftlichen Seite prägen die fünf Fachausschüsse FA Radartechnik, FA Inertialsensorik, FA Weltraumtechnik, FA Verkehrstelematik und FA Unterwasserortung, -navigation und -kommunikation unsere Organisation.